Lilly Keller setzte testamentarisch die Lilly Keller Stiftung als Erbin ihres Nachlasses ein. Dazu gehört neben ihren Werken die Liegenschaft an der Oberen Stallstrasse in Thusis mit ihrem bezaubernden, von der Künstlerin gestalteten Garten. Die Stiftung bezweckt zum einen das Erhalten und das Fördern der Kunst von Lilly Keller. Zum anderen strebt sie gemäss dem Willen der Stifterin die Umwandlung des Wohn- und Arbeitsortes der Künstlerin in einen kulturell lebendigen, für die Öffentlichkeit und für kreative Initiativen offenen Ort an.

Der seit Sommer 2018 tätige Stiftungsrat hat zunächst zwei wichtige Tätigkeitsfelder ausgemacht. Um den Erhalt und die weitere Bekanntmachung von Lilly Kellers Werk zu ermöglichen, ist zunächst ein umfassendes, gut strukturiertes Werkverzeichnis unabdingbar. Zweitens müssen gute Lagerbedingungen auch für die teils fragilen Kunstwerke gefunden werden.

Bereits jetzt betreibt die Stiftung zudem regelmässig Öffentlichkeitsarbeit, dies beispielsweise. 2019 mit einer Ausstellung im Kino Rätia, verbunden mit einem Open House-Anlass im Atelier, oder mit Leihgaben an Ausstellungen (Solothurn, Zürich).